Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rftn1Q6A0D4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms