Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms