Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmcc1Q69ZZ6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms