Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntn4Q69Z26 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn4Q69Z26 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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