Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp4Q68FH0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp4Q68FH0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms