Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC080695Q66JY9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms