Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sp9Q64HY3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sp9Q64HY3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sp9Q64HY3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms