Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms