Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Abcg1Q64343 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Abcg1Q64343 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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