Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf4Q64287 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf4Q64287 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf4Q64287 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf4Q64287 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms