Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms