Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms