Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc18Q640L5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
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