Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Polr2kQ63871 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms