Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CochQ62507 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CochQ62507 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms