Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lcn4Q62472 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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