Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms