Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms