Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms