Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm38Q62176 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms