Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prg2Q61878 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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