Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms