Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JrkQ60976 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms