Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grik1Q60934 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grik1Q60934 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms