Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Neurod1Q60867 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms