Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3Q60803 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms