Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdkn2dQ60773 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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