Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms