Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcf4Q60722 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms