Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms