Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tnfsf15Q5UBV8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms