Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Myh1Q5SX40 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms