Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsr1Q5SWD9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tsr1Q5SWD9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms