Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme4Q5SSW2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms