Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Utp18Q5SSI6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms