Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm12253Q5NC48 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm12253Q5NC48 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm12253Q5NC48 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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