Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps41Q5KU39 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms