Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C4

Vps13a, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 3,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13aQ5H8C4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13aQ5H8C4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms