Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms