Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grhl3Q5FWH3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grhl3Q5FWH3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms