Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrc8bQ5DU41 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms