Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt2Q5DTW2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms