Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syne3Q4FZC9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms