Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Carmil2Q3V3V9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Carmil2Q3V3V9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms