Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pydc3Q3V3Q4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pydc3Q3V3Q4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms