Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ckap2Q3V1H1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms