Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn34b4Q3V0X2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms