Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ttc9Q3V038 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9Q3V038 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ttc9Q3V038 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9Q3V038 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ttc9Q3V038 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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