Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms