Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E330034G19RikQ3UWX6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms